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# Expression génétique et génomique

# Traduction
ARNm -> Protétine
**Ribosome** : Complexe ribonucléoprotéique = $ARN_R$ + protéines
$ARN_R$ réalise la réaction qui relie 2 AA
$ARN_m$ = 3 nuc par 3 nuc = codons
Or $4^3 = 64$ donc plusieurs codons codent le même AA

## Cadre de lecture ouvert
Signaux de début et fin de traduction :
Protéine commence généralement par START AUG (Méthionine)
Codons STOP UAG UAA UGA
Séquences entre START et STOP

1. Toutes les ORF ne correspondent pas à des gènes exprimés
2. L'interprétation codon par codon de l'ADN n'a de sens que dans une ORF

## Implémentation du code génétique
3 nucs -> 1 AA
**Grâce à l'$ARN_t$** $\approx$ Anti-codon
- 21 $ARN_t$ (20 AA + 1 spécial pour la terminaison)
- Reconnaissance de tous les codons

1. Appariements non-canoniques entre G et U
2. Présence dans l'anti-codon d'un nucléotide modifié :
	- Inosine (I <-> A, I <-> U, I <-> C)
	- ex : Anti-codon IGC ->
		- ACG + AUG
		- UCG + UUG
		- CCG + CUG

## Ribosome
Complexe ribonucléoprotéique
1. Grande sous-unité -> polymérisation
2. petite sous-unité -> fixation sur l'ARN et déplacement 5' -> 3'

Ribosome fonctionnel -> assemblage de la petite et grande sous-unité sur de l'ARN

Le ribosome va arriver à se fixer sur le codon start de l'ARN

# Expression génétique eucaryote
Procaryote -> pas de noyau (ADN flottant dans le milieu de la cellule)
Eucaryote -> noyau pour protéger l'ADN

Présence de pore nucléaires dans la membrane nucléaire qui contrôlent l'IO

Transcription dans le noyau **mais** traduction dans le cytoplasme (ribosomes dans le cyto)
L'$ARN_m$ mature peut sortir du noyau

## Maturation de l'$ARN_m$
1. Chapeau -> coiffe 5' du noyau : Ajout d'un nucléotide (7-méthylguanosine)
2. Queue PolyAdénine 3' = AAAAAAAAAAA (possible > 100 A)
3. Epissage (splicing) : Chez eucaryotes séquence transcrite $\neq$ séquence traduite (chez procaryotes ok)
		2 types de sous-séquences, exons et introns ("$\verb|GU.*A.*AG|$"), on enlève les introns (et possiblement des exons)
		Epissage alternatif : différentes cellules peuvent épisser différentes combinaisons d'introns et d'exons (différentes protéines à partir des mêmes gènes)

Traduction uniquement si coiffe et queue
Export de l'$ARN_m$ mature dans le cytoplasme