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path: root/BINF
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authorMartial Simon <msimon_fr@hotmail.com>2026-02-20 12:03:43 +0100
committerMartial Simon <msimon_fr@hotmail.com>2026-02-20 12:03:43 +0100
commitb8cd420222553e00eb18b17e04a838e7527d730f (patch)
tree70814168a3863b2ba53a9cb5a1ac5ce53026fe5a /BINF
parentf066cebf3b972bbaefd59c26b75848c764c4fd34 (diff)
feat: BINF
Diffstat (limited to 'BINF')
-rw-r--r--BINF/BINF2026_Cours3.pdfbin0 -> 278495 bytes
-rw-r--r--BINF/Cours 3.md16
-rw-r--r--BINF/cours1.md43
-rw-r--r--BINF/cours2.md59
4 files changed, 117 insertions, 1 deletions
diff --git a/BINF/BINF2026_Cours3.pdf b/BINF/BINF2026_Cours3.pdf
new file mode 100644
index 0000000..f94bcbe
--- /dev/null
+++ b/BINF/BINF2026_Cours3.pdf
Binary files differ
diff --git a/BINF/Cours 3.md b/BINF/Cours 3.md
new file mode 100644
index 0000000..d2a61f4
--- /dev/null
+++ b/BINF/Cours 3.md
@@ -0,0 +1,16 @@
+# Réplication d'ADN
+Complexe protéique : **ADN polymérase**
+
+Réplication entière du génome qui démarre à une ou plusieurs origines de réplication
+
+Se propage de façon bidirectionnelle sur les 2 brins en parallèle
+
+Oeil de réplication déroulé par les 2 hélicases qui déroule le double brin d'ADN
+$ADN_{pol}$ -> 3' => 5' ne peut se fixer que sur une région d'ADN double brin == très chiant / gros relou
+
+ADN primase synthétise des batch de 10-20 nucléotides pour la réplication sur les amorces ARN (10-20)
+
+brin meneur 3' -> 5'
+brin retardé 5' -> 3', laisse des fragments d'Okazaki (100-200 paires de bases)
+amorces retirées par la RNAse H puis $ADN_{pol}$ vient se fixer sur les extrémités des fragments
+Attaches fragments-réplications tiennent qu'avec des liaisons H, consolidation des squelettes sucre-phosphate avec ligase \ No newline at end of file
diff --git a/BINF/cours1.md b/BINF/cours1.md
index c0cb1fb..76234da 100644
--- a/BINF/cours1.md
+++ b/BINF/cours1.md
@@ -56,4 +56,45 @@ Polaire = tendance de O à beaucoup attirer les $e^-$ des H
#### Bases azotées
**Pyrimidines** : 1 cycle -> Thymine et Cytosine
-**Purines** : 2 cycles -> Adénine et Guanine \ No newline at end of file
+**Purines** : 2 cycles -> Adénine et Guanine
+
+Taille du génome mesurée en Méga base (azotée)
+
+Ratio GC = $G+C / \verb|taille du génome|$
+
+## ARN
+- Acide Ribonucléique
+- Nucléotides : A Uracile G C
+- Complémentarité : A <-> U & G <-> C
+- Forme libre qui dépend des bases présentes => Appariement des nucléotides complémentaires sur un même brin
+- L'ARN contrôle la forme qu'il prend pour leur fonction :
+ - Messager : ADN -> ARNm -> Protéine
+ - Transfert : ARNt, Implémente le code génétique
+ - Ribosomique : ARNr, Intégré dans le ribosome
+### Transcription
+ADN -> ARN
+Réalisée par le complexe protéique (ARN polymérase, plusieurs protéines) qui se fixe sur l'ADN et le copie dans le sens $3' \rightarrow 5'$ sur un brin ou l'autre
+Copie créée = brin complémentaire inverse ($5' \rightarrow 3'$) en ARN
+
+#### A retenir
+- Lecture 3' -> 5'
+- ARN produit 5' -> 3'
+
+## Protéines
+- Polymère (chaînes) d'acides aminés (AA)
+- 20 AA possibles, différence au niveau de R (chaîne latérale / sidechain)
+- Variété de props d'AA influe sur les props physico-chimiques de la protéine et donc de sa fonction dans la cellule
+ - Dimensions
+ - Hydrophile ou hydrophobe
+ - Polarité
+ - Charge
+- Liaison entre 2 AA libère un H2O = condensation
+- Polymérisation de C vers N et chaîne de N vers C
+#### Structures des protéines
+- 1aire -> Séquence des AA
+- 2daire -> Repliement local de la chaîne d'AA, lié aux sidechains
+ - Hélice $\alpha$ (style slinky)
+ - Feuillet $\beta$ (style accordéon papier d'arménie)
+ - Non-structuré (style tshirt Reda)
+- 3aire -> Repliement global = forme
+- 4ernaire -> Association avec d'autres protéines \ No newline at end of file
diff --git a/BINF/cours2.md b/BINF/cours2.md
new file mode 100644
index 0000000..624b294
--- /dev/null
+++ b/BINF/cours2.md
@@ -0,0 +1,59 @@
+# Expression génétique et génomique
+
+# Traduction
+ARNm -> Protétine
+**Ribosome** : Complexe ribonucléoprotéique = $ARN_R$ + protéines
+$ARN_R$ réalise la réaction qui relie 2 AA
+$ARN_m$ = 3 nuc par 3 nuc = codons
+Or $4^3 = 64$ donc plusieurs codons codent le même AA
+
+## Cadre de lecture ouvert
+Signaux de début et fin de traduction :
+Protéine commence généralement par START AUG (Méthionine)
+Codons STOP UAG UAA UGA
+Séquences entre START et STOP
+
+1. Toutes les ORF ne correspondent pas à des gènes exprimés
+2. L'interprétation codon par codon de l'ADN n'a de sens que dans une ORF
+
+## Implémentation du code génétique
+3 nucs -> 1 AA
+**Grâce à l'$ARN_t$** $\approx$ Anti-codon
+- 21 $ARN_t$ (20 AA + 1 spécial pour la terminaison)
+- Reconnaissance de tous les codons
+
+1. Appariements non-canoniques entre G et U
+2. Présence dans l'anti-codon d'un nucléotide modifié :
+ - Inosine (I <-> A, I <-> U, I <-> C)
+ - ex : Anti-codon IGC ->
+ - ACG + AUG
+ - UCG + UUG
+ - CCG + CUG
+
+## Ribosome
+Complexe ribonucléoprotéique
+1. Grande sous-unité -> polymérisation
+2. petite sous-unité -> fixation sur l'ARN et déplacement 5' -> 3'
+
+Ribosome fonctionnel -> assemblage de la petite et grande sous-unité sur de l'ARN
+
+Le ribosome va arriver à se fixer sur le codon start de l'ARN
+
+# Expression génétique eucaryote
+Procaryote -> pas de noyau (ADN flottant dans le milieu de la cellule)
+Eucaryote -> noyau pour protéger l'ADN
+
+Présence de pore nucléaires dans la membrane nucléaire qui contrôlent l'IO
+
+Transcription dans le noyau **mais** traduction dans le cytoplasme (ribosomes dans le cyto)
+L'$ARN_m$ mature peut sortir du noyau
+
+## Maturation de l'$ARN_m$
+1. Chapeau -> coiffe 5' du noyau : Ajout d'un nucléotide (7-méthylguanosine)
+2. Queue PolyAdénine 3' = AAAAAAAAAAA (possible > 100 A)
+3. Epissage (splicing) : Chez eucaryotes séquence transcrite $\neq$ séquence traduite (chez procaryotes ok)
+ 2 types de sous-séquences, exons et introns ("$\verb|GU.*A.*AG|$"), on enlève les introns (et possiblement des exons)
+ Epissage alternatif : différentes cellules peuvent épisser différentes combinaisons d'introns et d'exons (différentes protéines à partir des mêmes gènes)
+
+Traduction uniquement si coiffe et queue
+Export de l'$ARN_m$ mature dans le cytoplasme \ No newline at end of file