From b8cd420222553e00eb18b17e04a838e7527d730f Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Martial Simon <msimon_fr@hotmail.com>
Date: Fri, 20 Feb 2026 12:03:43 +0100
Subject: feat: BINF

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 BINF/cours2.md | 59 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
 1 file changed, 59 insertions(+)
 create mode 100644 BINF/cours2.md

(limited to 'BINF/cours2.md')

diff --git a/BINF/cours2.md b/BINF/cours2.md
new file mode 100644
index 0000000..624b294
--- /dev/null
+++ b/BINF/cours2.md
@@ -0,0 +1,59 @@
+# Expression génétique et génomique
+
+# Traduction
+ARNm -> Protétine
+**Ribosome** : Complexe ribonucléoprotéique = $ARN_R$ + protéines
+$ARN_R$ réalise la réaction qui relie 2 AA
+$ARN_m$ = 3 nuc par 3 nuc = codons
+Or $4^3 = 64$ donc plusieurs codons codent le même AA
+
+## Cadre de lecture ouvert
+Signaux de début et fin de traduction :
+Protéine commence généralement par START AUG (Méthionine)
+Codons STOP UAG UAA UGA
+Séquences entre START et STOP
+
+1. Toutes les ORF ne correspondent pas à des gènes exprimés
+2. L'interprétation codon par codon de l'ADN n'a de sens que dans une ORF
+
+## Implémentation du code génétique
+3 nucs -> 1 AA
+**Grâce à l'$ARN_t$** $\approx$ Anti-codon
+- 21 $ARN_t$ (20 AA + 1 spécial pour la terminaison)
+- Reconnaissance de tous les codons
+
+1. Appariements non-canoniques entre G et U
+2. Présence dans l'anti-codon d'un nucléotide modifié :
+	- Inosine (I <-> A, I <-> U, I <-> C)
+	- ex : Anti-codon IGC ->
+		- ACG + AUG
+		- UCG + UUG
+		- CCG + CUG
+
+## Ribosome
+Complexe ribonucléoprotéique
+1. Grande sous-unité -> polymérisation
+2. petite sous-unité -> fixation sur l'ARN et déplacement 5' -> 3'
+
+Ribosome fonctionnel -> assemblage de la petite et grande sous-unité sur de l'ARN
+
+Le ribosome va arriver à se fixer sur le codon start de l'ARN
+
+# Expression génétique eucaryote
+Procaryote -> pas de noyau (ADN flottant dans le milieu de la cellule)
+Eucaryote -> noyau pour protéger l'ADN
+
+Présence de pore nucléaires dans la membrane nucléaire qui contrôlent l'IO
+
+Transcription dans le noyau **mais** traduction dans le cytoplasme (ribosomes dans le cyto)
+L'$ARN_m$ mature peut sortir du noyau
+
+## Maturation de l'$ARN_m$
+1. Chapeau -> coiffe 5' du noyau : Ajout d'un nucléotide (7-méthylguanosine)
+2. Queue PolyAdénine 3' = AAAAAAAAAAA (possible > 100 A)
+3. Epissage (splicing) : Chez eucaryotes séquence transcrite $\neq$ séquence traduite (chez procaryotes ok)
+		2 types de sous-séquences, exons et introns ("$\verb|GU.*A.*AG|$"), on enlève les introns (et possiblement des exons)
+		Epissage alternatif : différentes cellules peuvent épisser différentes combinaisons d'introns et d'exons (différentes protéines à partir des mêmes gènes)
+
+Traduction uniquement si coiffe et queue
+Export de l'$ARN_m$ mature dans le cytoplasme
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cgit v1.2.3